Sin dal 2000, anno della prima edizione, quella di Padova è sempre stata la "maratona della solidarietà". Una definizione che negli ultimi anni è ancora più calzante, perché il charity program abbinato all'evento è diventato, appunto, un vero e proprio "programma", cresciuto in partecipazione e fondi raccolti, sensibilizzando un pubblico sempre più vasto.
Nell'anno di Padova Capitale Europea del Volontariato, Padova Marathon ha pertanto voluto fortemente questa sinergia, puntando a essere tappa importante dell'anno in cui la città rappresenterà la solidarietà a livello internazionale. Alle associazioni che partecipano al charity program l'onore e l'onere di essere "ambasciatrici" di Padova Capitale.